Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BRCA2P51587 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA2P51587 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms