Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PAPOLAP51003 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAPOLAP51003 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms