Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAMP50895 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAMP50895 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAMP50895 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAMP50895 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAMP50895 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAMP50895 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAMP50895 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAMP50895 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAMP50895 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAMP50895 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAMP50895 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAMP50895 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAMP50895 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAMP50895 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAMP50895 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAMP50895 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAMP50895 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAMP50895 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAMP50895 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAMP50895 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAMP50895 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAMP50895 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAMP50895 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAMP50895 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAMP50895 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAMP50895 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BCAMP50895 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BCAMP50895 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BCAMP50895 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAMP50895 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAMP50895 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAMP50895 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAMP50895 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAMP50895 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAMP50895 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAMP50895 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAMP50895 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCAMP50895 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms