Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF6P49848 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF6P49848 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF6P49848 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF6P49848 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF6P49848 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF6P49848 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF6P49848 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF6P49848 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF6P49848 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF6P49848 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF6P49848 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF6P49848 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms