Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC2P49815 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC2P49815 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC2P49815 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC2P49815 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC2P49815 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC2P49815 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC2P49815 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC2P49815 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC2P49815 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC2P49815 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC2P49815 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC2P49815 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC2P49815 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC2P49815 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC2P49815 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC2P49815 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSC2P49815 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSC2P49815 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms