Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSEN1P49768 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms