Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PIP4K2AP48426 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIP4K2AP48426 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms