Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNJ1P48048 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNJ1P48048 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms