Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UTRNP46939 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UTRNP46939 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UTRNP46939 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UTRNP46939 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UTRNP46939 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
UTRNP46939 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UTRNP46939 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UTRNP46939 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UTRNP46939 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UTRNP46939 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UTRNP46939 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UTRNP46939 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UTRNP46939 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UTRNP46939 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UTRNP46939 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UTRNP46939 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UTRNP46939 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UTRNP46939 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
UTRNP46939 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UTRNP46939 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UTRNP46939 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UTRNP46939 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UTRNP46939 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UTRNP46939 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UTRNP46939 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UTRNP46939 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UTRNP46939 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UTRNP46939 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
UTRNP46939 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UTRNP46939 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms