Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL21P46778 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL21P46778 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL21P46778 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL21P46778 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL21P46778 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL21P46778 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL21P46778 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL21P46778 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL21P46778 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL21P46778 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL21P46778 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL21P46778 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL21P46778 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL21P46778 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL21P46778 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL21P46778 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms