Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCC3P46736 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRCC3P46736 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCC3P46736 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms