Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSFMP43897 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSFMP43897 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TSFMP43897 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSFMP43897 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSFMP43897 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TSFMP43897 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms