Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-1P43699 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-1P43699 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-1P43699 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-1P43699 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKX2-1P43699 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-1P43699 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKX2-1P43699 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKX2-1P43699 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms