Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC1A1P43005 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC1A1P43005 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms