Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARSP41250 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GARSP41250 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARSP41250 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARSP41250 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARSP41250 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARSP41250 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARSP41250 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARSP41250 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARSP41250 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARSP41250 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARSP41250 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms