Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPHP41219 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPHP41219 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPHP41219 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPHP41219 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPHP41219 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPHP41219 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPHP41219 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPHP41219 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPHP41219 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPHP41219 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPHP41219 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPHP41219 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPHP41219 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPHP41219 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPHP41219 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPHP41219 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPHP41219 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms