Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARL4AP40617 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARL4AP40617 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms