Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL1P40616 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL1P40616 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL1P40616 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL1P40616 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL1P40616 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARL1P40616 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARL1P40616 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARL1P40616 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARL1P40616 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARL1P40616 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARL1P40616 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARL1P40616 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARL1P40616 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms