Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YNR063WYNR063W 1824 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 SUC2YIL162W 1599 nt3.51□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 TGL3YMR313C 1929 nt3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 PCI8YIL071C 1335 nt3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 SDT1YGL224C 843 nt3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 MRP8YKL142W 660 nt3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 NSP1YJL041W 2472 nt3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 LCB5YLR260W 2064 nt3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 CIN8YEL061C 3003 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 KAP95YLR347C 2586 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 RPA190YOR341W 4995 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YDR431WYDR431W 312 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 ERV29YGR284C 933 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YJL028WYJL028W 336 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YLR225CYLR225C 1224 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 CDA2YLR308W 939 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 FDH2YPL275W 711 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 PTM1YKL039W 1572 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 EPO1YMR124W 2832 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 RAD7YJR052W 1698 nt3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YPK3YBR028C 1578 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 STT4YLR305C 5703 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 OAF3YKR064W 2592 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 MET10YFR030W 3108 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 SEA4YBL104C 3117 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YDL032WYDL032W 312 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 PET54YGR222W 882 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 RHO5YNL180C 996 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 VPS28YPL065W 729 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 MRPL51YPR100W 423 nt3.48□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 DNM1YLL001W 2274 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YGL214WYGL214W 486 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 OKP1YGR179C 1221 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 AGE2YIL044C 897 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YAR070CYAR070C 300 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 BYE1YKL005C 1785 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 PRM15YMR278W 1869 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 POL31YJR006W 1464 nt3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 TDA3YHR009C 1572 nt3.46□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 CSR2YPR030W 3366 nt3.46□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 DRS2YAL026C 4068 nt3.46□□□□□ -1.85
SHQ1P40486 YMR317WYMR317W 3423 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 RPL17AYKL180W 555 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 CMD1YBR109C 444 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YHR080CYHR080C 4038 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 GCN1YGL195W 8019 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 MGA1YGR249W 1371 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 TMA108YIL137C 2841 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 HDA2YDR295C 2025 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 DAP2YHR028C 2457 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 VPS30YPL120W 1674 nt3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 NEM1YHR004C 1341 nt3.45□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 HAT2YEL056W 1206 nt3.45□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YIL089WYIL089W 618 nt3.45□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 RIB5YBR256C 717 nt3.45□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 ETP1YHL010C 1758 nt3.45□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 CLB5YPR120C 1308 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 PMS1YNL082W 2622 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 STE14YDR410C 720 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 VFA1YER128W 612 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 DOG2YHR043C 741 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 ARC15YIL062C 465 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YIL175WYIL175W 318 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YBL081WYBL081W 1107 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 SIL1YOL031C 1266 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 ISM1YPL040C 3009 nt3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 ULP1YPL020C 1866 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 BAR1YIL015W 1764 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YGL082WYGL082W 1146 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YKT6YKL196C 603 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 REG2YBR050C 1017 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 NIP7YPL211W 546 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 HMS1YOR032C 1305 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 RPN2YIL075C 2838 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YVC1YOR087W 2028 nt3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 NOP4YPL043W 2058 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 SQS1YNL224C 2304 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 MGT1YDL200C 567 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 WBP1YEL002C 1293 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 USE1YGL098W 738 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 COX23YHR116W 456 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 SPO16YHR153C 597 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 MTR2YKL186C 555 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 TVP18YMR071C 504 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 CHS2YBR038W 2892 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 CPA2YJR109C 3357 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YGR117CYGR117C 1431 nt3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 MIC60YKR016W 1623 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 RPC11YDR045C 333 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 ECO1YFR027W 846 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YGL101WYGL101W 648 nt3.41□□□□□ -1.86
SHQ1P40486 YHR180WYHR180W 492 nt3.41□□□□□ -1.86
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