Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLT4P35916 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLT4P35916 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FLT4P35916 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FLT4P35916 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FLT4P35916 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FLT4P35916 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FLT4P35916 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FLT4P35916 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FLT4P35916 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FLT4P35916 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FLT4P35916 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FLT4P35916 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT4P35916 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT4P35916 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT4P35916 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FLT4P35916 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT4P35916 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT4P35916 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT4P35916 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT4P35916 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT4P35916 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FLT4P35916 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT4P35916 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT4P35916 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT4P35916 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT4P35916 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT4P35916 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT4P35916 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FLT4P35916 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FLT4P35916 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FLT4P35916 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms