Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BMI1P35226 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BMI1P35226 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BMI1P35226 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BMI1P35226 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BMI1P35226 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms