Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RYKP34925 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RYKP34925 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RYKP34925 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RYKP34925 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RYKP34925 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RYKP34925 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RYKP34925 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RYKP34925 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms