Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
L1CAMP32004 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1CAMP32004 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1CAMP32004 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms