Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC6A4P31645 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A4P31645 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms