Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA13P31271 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms