Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDI1P31150 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDI1P31150 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDI1P31150 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDI1P31150 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDI1P31150 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDI1P31150 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDI1P31150 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDI1P31150 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GDI1P31150 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDI1P31150 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDI1P31150 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDI1P31150 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDI1P31150 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDI1P31150 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDI1P31150 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDI1P31150 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDI1P31150 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms