Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFRSF8P28908 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms