Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
SSFA2P28290 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SSFA2P28290 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms