Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
DNMT1P26358 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms