Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NFKBIAP25963 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms