Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTSSP25774 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTSSP25774 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTSSP25774 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTSSP25774 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTSSP25774 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTSSP25774 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTSSP25774 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms