Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRGP23470 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PTPRGP23470 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRGP23470 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
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