Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCP2P22307 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCP2P22307 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCP2P22307 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCP2P22307 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCP2P22307 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCP2P22307 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCP2P22307 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCP2P22307 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCP2P22307 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCP2P22307 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCP2P22307 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCP2P22307 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms