Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VDAC1P21796 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VDAC1P21796 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms