Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
TRHP20396 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRHP20396 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TRHP20396 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TRHP20396 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TRHP20396 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRHP20396 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TRHP20396 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRHP20396 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRHP20396 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRHP20396 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRHP20396 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TRHP20396 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TRHP20396 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRHP20396 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRHP20396 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRHP20396 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRHP20396 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRHP20396 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRHP20396 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRHP20396 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRHP20396 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRHP20396 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRHP20396 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRHP20396 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRHP20396 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRHP20396 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRHP20396 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRHP20396 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRHP20396 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRHP20396 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRHP20396 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TRHP20396 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRHP20396 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRHP20396 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRHP20396 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRHP20396 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms