Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2B1P20020 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms