Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNNI3P19429 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNNI3P19429 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms