Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XRCC1P18887 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XRCC1P18887 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms