Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCP1P17987 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCP1P17987 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCP1P17987 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCP1P17987 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCP1P17987 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCP1P17987 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCP1P17987 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCP1P17987 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCP1P17987 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCP1P17987 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms