Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms