Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSP16219 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSP16219 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSP16219 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSP16219 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACADSP16219 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms