Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD44P16070 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD44P16070 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD44P16070 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD44P16070 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD44P16070 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD44P16070 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD44P16070 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD44P16070 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD44P16070 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD44P16070 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD44P16070 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD44P16070 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD44P16070 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CD44P16070 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD44P16070 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD44P16070 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD44P16070 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD44P16070 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD44P16070 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD44P16070 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD44P16070 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD44P16070 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD44P16070 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD44P16070 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD44P16070 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD44P16070 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD44P16070 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD44P16070 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms