Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VEGFAP15692 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VEGFAP15692 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VEGFAP15692 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms