Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATF2P15336 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATF2P15336 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATF2P15336 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATF2P15336 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF2P15336 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF2P15336 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF2P15336 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF2P15336 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF2P15336 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms