Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD8P13378 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD8P13378 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms