Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM17P0DL12 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM17P0DL12 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms