Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF728P0DKX0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF728P0DKX0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms