Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGPD2P0DJD1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD2P0DJD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGPD2P0DJD1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms