Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM6P0DI80 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms