Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM228BP0C875 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM228BP0C875 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms